| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Cerrados. |
|
Data corrente: |
14/02/2011 |
|
Data da última atualização: |
14/02/2011 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
|
Autoria: |
PIRES, B. C.; LOPES, T. L.; VIU, M. A. DE O.; MAGNABOSCO, C. de U.; FARIA, C. U.; MAMEDE, M. M. S.; FERRAZ, H. T. |
|
Afiliação: |
BRUNO CARLOS PIRES, UFG; TOLEDO LOPES LOPES, UFG; MARCO ANTONIO DE OLIVEIRA VIU, UFG; CLAUDIO DE ULHOA MAGNABOSCO, CPAC; CARINA UBIRAJARA FARIA, UFU; MARIANA MÁRCIA SANTOS MAMEDE, UFG; HENRIQUE TREVIZOLI FERRAZ, UFG. |
|
Título: |
Estimativas de parâmetros genéticos de características andrológicas de touros jovens da raça Nelore, por meio da inferência bayesiana. |
|
Ano de publicação: |
2010 |
|
Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO DE PESQUISA, ENSINO E EXTENSÃO, 2010, Goiânia. Anais... Goiânia: UFG, 2010. 1 CD-ROM. p. 7625-7629. CONPEEX 2010. |
|
Idioma: |
Português |
|
Palavras-Chave: |
Andrologia; Nelore. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
Marc: |
LEADER 00717naa a2200205 a 4500
001 1876991
005 2011-02-14
008 2010 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aPIRES, B. C.
245 $aEstimativas de parâmetros genéticos de características andrológicas de touros jovens da raça Nelore, por meio da inferência bayesiana.
260 $c2010
653 $aAndrologia
653 $aNelore
700 1 $aLOPES, T. L.
700 1 $aVIU, M. A. DE O.
700 1 $aMAGNABOSCO, C. de U.
700 1 $aFARIA, C. U.
700 1 $aMAMEDE, M. M. S.
700 1 $aFERRAZ, H. T.
773 $tIn: CONGRESSO DE PESQUISA, ENSINO E EXTENSÃO, 2010, Goiânia. Anais... Goiânia: UFG, 2010. 1 CD-ROM. p. 7625-7629. CONPEEX 2010.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Cerrados (CPAC) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
|
Data corrente: |
09/10/2020 |
|
Data da última atualização: |
09/10/2020 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Circulação/Nível: |
A - 1 |
|
Autoria: |
SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; ROCHA, M. I. P.; BRUSCADIN, J. J.; DINIZ, W. J. da S.; CARDOSO, T. F.; CESAR, A. S. M.; AFONSO, J.; ANDRADE, B. G. N.; MUDADU, M. de A.; MOKRY, F. B.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. |
|
Afiliação: |
MARCELA MARIA DE SOUZA, UFSCar; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; MARINA IBELLI PEREIRA ROCHA, UFSCar; JENNIFER JESSICA BRUSCADIN, UFSCar; WELLISON JARLES DA SILVA DINIZ, UFSCar; TAINÃ FIGUEIREDO CARDOSO; ALINE SILVA MELLO CESAR, ESALQ/USP; JULIANA AFONSO, UFSCar; BRUNO GABRIEL NASCIMENTO ANDRADE, UFSCar; MAURICIO DE ALVARENGA MUDADU, CNPTIA; FABIANA BARICHELLO MOKRY, UFSCar; POLYANA CRISTINE TIZIOTO, NGS Soluções Genômicas, Piracicaba; PRISCILA SILVA NEUBERN DE OLIVEIRA; SIMONE CRISTINA MEO NICIURA, CPPSE; LUIZ LEHMANN COUTINHO, ESALQ/USP; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
|
Título: |
Allele-specific expression is widespread in Bos indicus muscle and affects meat quality candidate genes. |
|
Ano de publicação: |
2020 |
|
Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 10, n. 1, p. 1-11, 2020. |
|
DOI: |
https://doi.org/10.1038/S41598-020-67089-0 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Notas: |
Na publicação: Adhemar Zerlotini. Article number: 10204. |
|
Conteúdo: |
Differences between the expression of the two alleles of a gene are known as allele-specific expression (ASE), a common event in the transcriptome of mammals. Despite ASE being a source of phenotypic variation, its occurrence and effects on genetic prediction of economically relevant traits are still unexplored in bovines. Furthermore, as ASE events are likely driven by cis-regulatory mutations, scanning them throughout the bovine genome represents a significant step to elucidate the mechanisms underlying gene expression regulation. To address this question in a Bos indicus population, we built the ASE profile of the skeletal muscle tissue of 190 Nelore steers, using RNA sequencing data and SNPs genotypes from the Illumina BovineHD BeadChip (770 K bp). After quality control, 820 SNPs showed at least one sample with ASE. These SNPs were widespread among all autosomal chromosomes, being 32.01% found in 3'UTR and 31.41% in coding regions. We observed a considerable variation of ASE profile among individuals, which highlighted the need for biological replicates in ASE studies. Functional analysis revealed that ASE genes play critical biological functions in the development and maintenance of muscle tissue. Additionally, some of these genes were previously reported as associated with beef production and quality traits in livestock, thus indicating a possible source of bias on genomic predictions for these traits. |
|
Palavras-Chave: |
Allele-specific expression; Allelic expression; Expressão gênica; Regulação da expressão gênica. |
|
Thesagro: |
Bos Indicus. |
|
Thesaurus NAL: |
Gene expression regulation. |
|
Categoria do assunto: |
--
G Melhoramento Genético |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/216548/1/AP-Allele-specific-2020.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02698naa a2200397 a 4500
001 2125395
005 2020-10-09
008 2020 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1038/S41598-020-67089-0$2DOI
100 1 $aSOUZA, M. M. de
245 $aAllele-specific expression is widespread in Bos indicus muscle and affects meat quality candidate genes.$h[electronic resource]
260 $c2020
500 $aNa publicação: Adhemar Zerlotini. Article number: 10204.
520 $aDifferences between the expression of the two alleles of a gene are known as allele-specific expression (ASE), a common event in the transcriptome of mammals. Despite ASE being a source of phenotypic variation, its occurrence and effects on genetic prediction of economically relevant traits are still unexplored in bovines. Furthermore, as ASE events are likely driven by cis-regulatory mutations, scanning them throughout the bovine genome represents a significant step to elucidate the mechanisms underlying gene expression regulation. To address this question in a Bos indicus population, we built the ASE profile of the skeletal muscle tissue of 190 Nelore steers, using RNA sequencing data and SNPs genotypes from the Illumina BovineHD BeadChip (770 K bp). After quality control, 820 SNPs showed at least one sample with ASE. These SNPs were widespread among all autosomal chromosomes, being 32.01% found in 3'UTR and 31.41% in coding regions. We observed a considerable variation of ASE profile among individuals, which highlighted the need for biological replicates in ASE studies. Functional analysis revealed that ASE genes play critical biological functions in the development and maintenance of muscle tissue. Additionally, some of these genes were previously reported as associated with beef production and quality traits in livestock, thus indicating a possible source of bias on genomic predictions for these traits.
650 $aGene expression regulation
650 $aBos Indicus
653 $aAllele-specific expression
653 $aAllelic expression
653 $aExpressão gênica
653 $aRegulação da expressão gênica
700 1 $aZERLOTINI NETO, A.
700 1 $aROCHA, M. I. P.
700 1 $aBRUSCADIN, J. J.
700 1 $aDINIZ, W. J. da S.
700 1 $aCARDOSO, T. F.
700 1 $aCESAR, A. S. M.
700 1 $aAFONSO, J.
700 1 $aANDRADE, B. G. N.
700 1 $aMUDADU, M. de A.
700 1 $aMOKRY, F. B.
700 1 $aTIZIOTO, P. C.
700 1 $aOLIVEIRA, P. S. N. de
700 1 $aNICIURA, S. C. M.
700 1 $aCOUTINHO, L. L.
700 1 $aREGITANO, L. C. de A.
773 $tScientific Reports$gv. 10, n. 1, p. 1-11, 2020.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|
